The Jungle Book 2 เปิดเรื่องต่อจากตอนจบของภาคแรก เมื่อ เมาคลี (เสียงพากย์โดย เฮลี่ย์ โจล ออสเมนต์) ต้องเรียนรู้การใช้ชีวิต ใน 2 โลกที่แตกต่างกัน ตอนนี้เด็กชายลูกหมาป่า อาศัยอยู่ในหมู่บ้านมนุษย์ และได้เรียนรู้เรื่องความรัก ของครอบครัวเป็นครั้งแรก ชีวิตใหม่ของเขาประกอบด้วย รานจัน (เสียงพากย์โดย คอนเนอร์ ฟังค์) น้องชาย และ ชานติ (เสียงพากย์โดย เม วิตแมน) เด็กสาวเพื่อนสนิท ที่ชักนำเขาออกจากป่า แต่การใช้ชีวิตในหมู่บ้านแบบนี้ ย่อมหมายถึงการต้องคอยปฏิบัติตามกฎเกณฑ์ของมนุษย์ ซึ่งทำให้เขาต้องสูญเสียอิสรภาพ ที่เขามีเมื่อครั้งเติบโตอยู่กลางป่าด้วย
ที่ยิ่งกว่านั้น ลึกลงไปในหัวใจของเมาคลีแล้ว เขายังคงผูกพันกับป่าอยู่ไม่เปลี่ยนแปลง เขาคิดถึง บาลู (เสียงพากย์โดย จอห์น กู๊ดแมน) เพื่อนซี้ผู้ก็เฝ้าแต่โหยหาเขาอยู่เช่นเดียวกัน จน แบคกีรา (เสียงพากย์โดย บ๊อบ โจลส์) เสือแสนฉลาด กับ นายพลฮาติ (เสียงพากย์โดย จิม คัมมิ่งส์) แห่งกองทหารช้าง ต้องคอยห้ามไม่ให้บาลู ไปก่อกวนชีวิตใหม่ของเมาคลีมากนัก เมาคลีมักร้องเพลง 'Jungle Rhythm' คลอไปด้วยเสมอ ระหว่างก่อกวนเด็กคนอื่นในหมู่บ้าน ซึ่งล้วนแต่ถูกพร่ำสอนมาตั้งแต่เกิด ถึงอันตรายของป่า และถูกสั่งห้ามไม่ให้เหยียบ เข้าไปในดินแดนลึกลับนี้ แต่เพลงที่น่ารักของเมาคลี ก็ล่อใจเด็กๆ ให้เดินเข้าป่า จนสร้างความโมโหแก่พ่อเลี้ยงของเมาคลีมาก เจ้าหนูจึงถูกลงโทษทันที โทษฐานไม่เชื่อฟัง
ในขณะเดียวกัน บาลูก็หาใช่เพียงคนเดียวไม่ ที่เฝ้ารอจะได้พบเมาคลีอีกสักหน แต่ เชียร์คาน (เสียงพากย์โดย โทนี่ เจย์) เสือกินคน ก็นับวันรอที่จะได้แก้แค้นเจ้าลูกหมาป่าให้สาแก่ใจ มันแอบย่องเข้าหมู่บ้าน แต่เมาคลีก็หนีเข้าป่าไปได้ ด้วยความช่วยเหลือของบาลู ทำให้ ชานติ เป็นห่วงเป็นใยมาก จนต้องเอาชนะความกลัวป่าของเธอ แล้วติดตามเขาไป โดยไม่ทันรู้ตัวว่า ยังมีเจ้าหนู รานจัน แอบตามเธอมาด้วยอีกคนหนึ่ง
บาลูพยายามเกลี้ยกล่อมเมาคลีว่า บ้านที่แท้จริงของเขาคือป่า ด้วยเพลงพร้อมโชว์ตระการตา "W-I-L-D" สไตล์ บัสบี้ เบิร์คลี่ย์ แต่ความสนุกก็ไม่ได้คงอยู่ตลอดไป นอกจาก คา (เสียงพากย์โดย จิม คัมมิ่งส์) งูสะกดจิต จะเลื้อยออกหาของว่างขบเคี้ยว ในเวลาเดียวกันนั้นแล้ว เชียร์คาน ผู้กระหายการล้างแค้น ยังไล่ล่าตามมาอย่างกระชั้นชิด เช่นเดียวกับชาวบ้านทั้งหมู่บ้าน ที่ยกพลบุกป่า เพื่อตามหาเมาคลี ทั้ง ชานติ และบาลู ต้องแท็กทีมกันช่วยเจ้าหนูลูกหมาป่า ให้รอดพ้นจากกรงเล็บของเสือร้าย ขณะที่ตัวเมาคลีเอง ก็ต้องขัดแย้งกับการตัดสินใจ เลือกอย่างใดอย่างหนึ่ง ระหว่างเพื่อนเก่า และครอบครัวใหม่ด้วย...